次氯酸鈉水溶液中的殺菌有效成分是次氯酸根，有效氯殘留濃度指標中只含有 20% 左右，因此以較高濃度大量使用為主。而次氯酸水消毒液能夠在很低濃度時高效率殺菌，不會像次氯酸鈉一樣具有刺激性氣味。兒童接觸也很安全，又因為無殘留，使用后也無需用清水沖洗。